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요약 외관적으로 뚜렷한 자실체를 갖는 버섯류와 단세포성 효모류를 제외한 균류가 생존하는 환경 조건.
빛
태양 광선은 지표면의 어떤 환경 속에나 있는 자연 조건으로 일부 깊은 땅속에 서식하거나, 숙주 조직에 기생하는 것을 제외한 모든 곰팡이들은 낮과 밤의 주기적인 변화에 잘 적응되어 있다. 이러한 낮과 밤의 주기적인 변화에 의한 생리적인 주기성을 일주기라고 한다.
대부분의 곰팡이들은 빛에 그리 민감하지 않으나 강한 빛에 의해 성장이 저해된다. 빛에 의한 성장 저해는 배지에 영양물질을 첨가함으로써 극복할 수 있는 것으로 보아 빛이 직접적으로 작용하기보다는 비타민류와 같은 영양소를 파괴하여 일어나는 2차적인 효과를 주는 것으로 짐작 된다. 일반적으로 빛은 생식기관의 형성과 이동 등 생식에 더 많은 영향을 미친다.
습기
곰팡이는 상대적으로 많은 수분을 요구하지만, 고등한 것은 유리된 물이 없어도 살 수 있다. 대부분의 곰팡이들은 상대습도가 95~100%일 때 가장 잘 자란다. 토양에 서식하는 곰팡이는 중간 정도의 습도에서 가장 잘 자라는데, 그 이유는 습도가 높으면 토양 속의 환기가 원활하지 않아 산소 공급이 제한되기 때문이다.
온도
대부분의 곰팡이는 10~40℃에서 살아가며, 최적 온도는 25~35℃이다. 냉장식품을 부패시키는 곰팡이들은 낮은 온도에서도 잘 자란다. 사람의 병원균들은 37℃가 최적 온도이지만, 흙과 같은 자연 상태에서 서식할 때에는 25℃가 최적 온도이다.
산성도
대부분의 실험실에서 배양할 수 있는 곰팡이들은 pH 4.5~8.0의 폭넓은 영역을 보인다. 일반적으로 세균의 최적 산성도가 pH 7.0인데 비해 곰팡이의 최적 산성도는 pH 5.0~5.5로 약간 산성인 상태를 좋아한다.
산소
대부분의 곰팡이는 절대적으로 산소를 필요로 하는 호기성이지만, 푸사리움 옥시스포룸, 무코르 히말리스, 아스페르길루스 푸미가투스 등과 같이 당(糖)을 발효함으로써 산소없이 살 수 있는 것도 있다. 고인물에 서식하는 아쿠알린데렐라 페르멘탄스와 블라스토클라디아 라모사는 산소가 있어도 전적으로 발효에 의해 에너지를 얻는다.
이러한 곰팡이들의 세포에는 호흡에 필요한 세포기관인 미토콘드리아나 그 효소인 시토크롬이 없거나 발달이 미미하다. 이들을 '절대 발효성'이라고 한다. 양의 혹 위에서 볼 수 있는 네오칼리마스트릭스 프론탈리스, 스파이로모나스 콤무니스는 산소에 조금만 노출되어도 죽는 '절대 혐기성'이다.
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