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1890년대 미국 심리학 형성기에 큰 영향을 미쳤다. 다윈의 진화론과 심리학의 관계에 관심을 갖고 개인차에 대한 연구를 지지했으며, 심리학에서 이론의 중요성을 강조하고 편협한 실험주의를 비판했다.

1884~85년 베를린과 라이프치히대학에서 1년 동안 공부하면서, 새로운 실험심리학과 그 창시자인 빌헬름 분트를 알게 되었고 이 새로운 실험심리학 분야를 다룬 영어 교재의 필요성이 날로 높아짐에 따라 〈심리학 편람 Handbook of Psychology〉(2권, 1889~91)을 썼다.

1889년 캐나다 토론토대학교의 철학 교수가 되어, 이 대학에 심리학 연구소를 세웠다. 1893~1903년 프린스턴대학교 심리학과 철학 교수로 재직하면서 이 대학에 또 하나의 연구소를 세웠으며, 심리학에서의 진화론적 원리를 옹호하는 〈아동과 인종의 정신발달 Mental Development in the Child and the Race〉(1895)과 〈정신발달의 사회적·윤리적 해석 Social and Ethical Interpretations in Mental Development〉(1897)이라는 2권의 저서를 출판했다.

1894년 제임스 매킨 커텔과 함께 〈심리학 평론 Psychological Review〉지(誌)를 창간했는데, 이 잡지사에서는 〈심리학 색인 Psychological Index〉·〈심리학 회보 Psychological Bulletin〉 등의 간행물도 발간했다.

볼드윈은 약 60명의 철학자와 심리학자의 기고문을 편집하여 〈철학과 심리학 사전 Dictionary of Philosophy and Psychology〉(3권, 1901~05)을 출판했고, 마지막 권에는 벤저민 랜드가 편찬한 1,200페이지에 이르는 참고문헌 목록을 수록했다. 1903~09년 볼티모어의 존스홉킨스대학교와 합동으로, 5년 동안 멕시코 시에서 멕시코 국립대학교 고문으로 일했다.

이 시기에 그는 사고와 의미의 본질 및 발달을 조사한 〈발생논리학 Genetic Logic〉(3권, 1906~11)을 완성했다. 1913년 파리에 정착하여 여러 지방대학교에서 강의했으며, 1919년에는 파리의 '고등교육학교' 교수가 되었다.