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10만 번의 부검(그 가운데 3만 번은 자신이 직접 부검했음) 사례를 통해 질병에 걸린 장기(臟器)의 병리에 대한 체계적인 연구를 했는데 이것은 해부병리학이 현대의학에 꼭 필요한 기초가 되게 했으며, 19세기 후반 신(新)빈대학교가 세계 의학의 중심이 되게 하였다. 빈 종합병원의 해부병리 교수로 있을 때(1844~74) 보헤미아 출신 학생 이그나츠 제멜바이스에게 의학공부를 하도록 영향을 주었는데(1846) 그는 뒤에 소독의 발전에 크게 이바지했으며, 유럽의 산과(産科) 병동을 깨끗하게 유지하여 산욕열(産褥熱)을 추방하려고 노력한 로키탄스키를 도와주었다.

심장 내면을 덮고 있는 막에 생기는 염증으로 때로는 급격하게 악화되어 죽기도 하는 악성심내막염(惡性心內膜炎) 원인균을 알아내기 위한 연구를 하다가 로키탄스키는 대엽성폐렴(大葉性肺炎：폐의 하엽에서 주로 시작되는 폐렴)과 소엽성폐렴(小葉性肺炎：기관지폐렴이라고도 하는데 세기관지에서 시작되는 폐렴)을 구별할 수 있는 기초를 확립하였다. 그는 또 급성황색간위축(急性黃色肝萎縮：지금은 로키탄스키병이라고 함, 1843)도 연구했고 종말세기관지보다 원위부에 있는 폐포의 공기공간이 늘어나는 폐기종의 현미경적 소견을 밝혀냈으며, 척추뼈가 앞으로 튀어나오는 척추전방전위증(脊椎前方轉位症)을 처음으로 기술하였다(1839).

그밖에 〈해부병리지침서 Handbuch der Pathologischen Anatomie〉(3권, 1842~46)는 해부병리 기술을 정립된 과학의 수준으로 끌어올렸다.