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염증, 결핵, 그밖의 다른 질병에 감염된 동물 조직에서 일어나는 병적인 변화를 결정하는 데 도움을 주었다.

1865~68년 베를린의 병리학연구소에서 일했는데, 병리학의 창시자인 R. 피르호의 뛰어난 제자였다. 피르호를 돕는 동안 염증의 원인에 관한 광범위한 연구를 했다. 1867년 염증은 백혈구가 모세혈관 벽을 통과해 조직 속으로 이동함으로써 유발되며, 고름은 주로 이러한 백혈구가 파괴되어 형성된 파편들로 이루어져 있다는 초기의 의문들을 확인했다. 그는 이러한 발견들을 〈염증에 관한 최근의 연구들 Neue Untersuchungen über die Entzündung〉(1873) 속에 기술했다.

1868~72년 킬대학교와 1872~78년 브레슬라우대학교에서 병리학교수로 재직했으며, 1876년 그곳에서 로베르트 코흐의 탄저균(炭疽菌)의 감염성에 대한 역사적인 증명을 지켜보았다. 콘하임이 토끼 눈의 안구앞방[前室]에 결핵균을 유도시킴으로써, 1년 후 코흐가 결핵균을 발견하는 계기가 되었다.

그의 〈일반 병리학 강의 Vorlesungen über allgemeine Pathologie〉(2권, 1877~80)는 동시대의 교재들에 비해 훨씬 오래 사용되었으며, 현미경 검사를 위해 조직을 얇게 자르기 전에 얼리는 그의 방법은 지금은 기준적인 임상과정이 되었다.