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디지털 통신 및 신호처리 분야의 탁월한 연구자였다. 은종관은 미국 델라웨어대학교에서 1964년 전자공학 학사학위, 1966년 석사학위, 1969년 전자공학 박사학위를 취득한 뒤 1969~77년 미국 메인대학교 전자공학과 조교수와 스탠퍼드 연구소의 책임연구원을 거쳤다.

이 기간 동안 통신 및 시스템 분야의 강의를 하면서 디지털 통신의 싱크로나이제이션(synchronization)과 음성신호의 부호화에 관해 연구했고, 잡음 존재시의 VLF MSK 모뎀 성능 연구, ADM·ADPCM 등 디지털 음성부호화 방법 연구를 비롯해 디지털 통신 및 신호처리 분야에서 다양한 연구를 수행했다. 국외에서 268편, 국내에서 94편에 달하는 논문을 발표했으며 미국과 국내에서 특허권 7개를 획득했다.

1977년부터 한국과학기술원 전기·전자공학과 교수를 지냈으며 1982~83년 공과대학장, 1983~89년 통신공학연구실장 등을 역임했다. 그는 이 기간 동안 음성 다이얼링 전화기 개발, 디지털 음성처리 및 한국어 음성인식기술 연구 개발, 음성우편 시스템 개발, 청각 모델을 이용한 음성신호처리 등 70여 위탁연구를 성공적으로 수행하기도 했다. 국민훈장 동백장(1982), 한국과학기술원 학술대상(1995) 등을 수상했다. 한국과학기술 한림원 종신회원(1995), 한국공학원 창립회원(1996) 등을 지냈다.