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그의 저서 〈생명의 순환 Kreislauf des Lebens〉(1852)은 "과학적 문제는 과학적으로 대답해야 한다"고 주장함으로써 19세기 유물론에 상당한 자극을 주었다. 몰레스호트는 "인이 없으면 사상도 없다"는 말로 잘 알려져 있다.

의식이나 그와 비슷한 주제에 대한 고찰은 교회나 국가의 고유영역이라고 주장한 독일 대학들의 '공식 철학'에 반대하여, 저명한 과학자들에게 공적 요구를 거부하라고 촉구함으로써 과학적 탐구를 국가의 통제에서 벗어나게 하려 했다. 그의 가르침이 함축하고 있는 의미 때문에 독일에서 추방당한 뒤, 취리히·토리노·로마에서 계속해서 생리학교수로 일했다. 식이요법에 대한 연구로도 널리 인정받고 상도 많이 탔다.